Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL22Q53GT1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms