Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms