Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TWISTNBQ3B726 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms