Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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GEN1Q17RS7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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