Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms