Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDKN3Q16667 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDKN3Q16667 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDKN3Q16667 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDKN3Q16667 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDKN3Q16667 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDKN3Q16667 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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