Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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