Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SSX1Q16384 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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