Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms