Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms