Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms