Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PDCD1Q15116 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PDCD1Q15116 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PDCD1Q15116 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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