Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms