Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms