Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms