Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms