Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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APOFQ13790 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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APOFQ13790 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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