Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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