Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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