Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms