Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms