Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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