Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms