Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms