Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC051619.5-203ENST00000561404 529 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HNRNPKP2-201ENST00000447355 1390 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms