Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms