Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms