Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms