Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP3K9P80192 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP3K9P80192 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms