Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IRX1P78414 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IRX1P78414 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IRX1P78414 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IRX1P78414 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IRX1P78414 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRX1P78414 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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