Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2P78314 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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