Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms