Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms