Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms