Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms