Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA2P51531 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms