Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNA2P51530 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNA2P51530 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms