Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms