Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK8P49336 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms