Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN1P49257 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms