Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ME1P48163 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ME1P48163 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ME1P48163 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ME1P48163 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms