Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGIRP43119 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms