Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4AP40617 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4AP40617 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms