Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms