Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms