Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms