Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BCKDHBP21953 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BCKDHBP21953 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BCKDHBP21953 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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