Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTLA4P16410 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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