Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB1P16220 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB1P16220 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms