Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAV1P15498 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAV1P15498 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms